O cloridrato de vancomicina é derivado do composto natural vancomicina, que foi isolado pela primeira vez da bactéria Streptomyces orientalis na década de 1950. É usado principalmente para tratar infecções bacterianas graves causadas por organismos Gram-positivos, incluindo Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) e espécies de Enterococcus.